Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms