Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms