Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms