Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms