Protein–RNA interactions for Protein: Q02357

Ank1, Ankyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ank1Q02357 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ank1Q02357 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ank1Q02357 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ank1Q02357 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ank1Q02357 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ank1Q02357 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ank1Q02357 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ank1Q02357 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ank1Q02357 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ank1Q02357 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ank1Q02357 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ank1Q02357 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ank1Q02357 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ank1Q02357 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ank1Q02357 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ank1Q02357 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ank1Q02357 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ank1Q02357 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ank1Q02357 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ank1Q02357 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ank1Q02357 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ank1Q02357 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ank1Q02357 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ank1Q02357 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ank1Q02357 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ank1Q02357 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ank1Q02357 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ank1Q02357 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ank1Q02357 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ank1Q02357 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ank1Q02357 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ank1Q02357 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ank1Q02357 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ank1Q02357 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ank1Q02357 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ank1Q02357 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ank1Q02357 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ank1Q02357 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ank1Q02357 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ank1Q02357 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ank1Q02357 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ank1Q02357 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ank1Q02357 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ank1Q02357 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ank1Q02357 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ank1Q02357 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms