Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms