Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RykQ01887 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RykQ01887 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RykQ01887 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RykQ01887 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RykQ01887 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RykQ01887 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RykQ01887 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RykQ01887 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RykQ01887 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RykQ01887 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RykQ01887 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RykQ01887 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RykQ01887 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RykQ01887 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RykQ01887 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RykQ01887 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RykQ01887 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RykQ01887 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RykQ01887 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RykQ01887 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RykQ01887 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RykQ01887 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RykQ01887 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RykQ01887 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RykQ01887 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RykQ01887 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RykQ01887 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RykQ01887 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RykQ01887 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RykQ01887 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RykQ01887 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RykQ01887 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RykQ01887 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RykQ01887 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RykQ01887 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RykQ01887 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RykQ01887 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RykQ01887 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RykQ01887 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RykQ01887 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RykQ01887 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RykQ01887 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RykQ01887 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RykQ01887 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RykQ01887 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RykQ01887 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RykQ01887 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RykQ01887 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RykQ01887 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RykQ01887 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RykQ01887 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RykQ01887 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RykQ01887 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RykQ01887 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RykQ01887 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RykQ01887 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RykQ01887 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RykQ01887 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RykQ01887 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RykQ01887 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RykQ01887 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RykQ01887 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RykQ01887 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RykQ01887 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RykQ01887 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RykQ01887 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RykQ01887 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RykQ01887 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RykQ01887 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RykQ01887 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RykQ01887 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RykQ01887 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RykQ01887 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RykQ01887 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RykQ01887 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RykQ01887 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RykQ01887 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RykQ01887 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RykQ01887 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RykQ01887 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RykQ01887 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RykQ01887 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RykQ01887 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RykQ01887 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RykQ01887 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RykQ01887 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RykQ01887 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RykQ01887 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RykQ01887 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RykQ01887 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RykQ01887 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RykQ01887 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RykQ01887 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RykQ01887 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RykQ01887 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RykQ01887 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RykQ01887 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RykQ01887 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RykQ01887 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms