Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms