Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms