Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms