Protein–RNA interactions for Protein: Q00609

Cd80, T-lymphocyte activation antigen CD80, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd80Q00609 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cd80Q00609 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd80Q00609 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd80Q00609 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd80Q00609 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd80Q00609 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd80Q00609 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd80Q00609 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd80Q00609 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd80Q00609 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd80Q00609 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd80Q00609 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd80Q00609 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd80Q00609 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd80Q00609 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd80Q00609 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd80Q00609 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd80Q00609 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd80Q00609 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd80Q00609 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms