Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms