Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms