Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cds1P98191 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cds1P98191 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cds1P98191 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cds1P98191 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cds1P98191 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cds1P98191 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cds1P98191 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cds1P98191 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cds1P98191 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cds1P98191 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cds1P98191 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cds1P98191 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cds1P98191 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cds1P98191 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms