Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cry1P97784 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cry1P97784 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms