Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smyd1P97443 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smyd1P97443 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smyd1P97443 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smyd1P97443 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smyd1P97443 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smyd1P97443 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smyd1P97443 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms