Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhodP97348 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhodP97348 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhodP97348 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhodP97348 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhodP97348 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhodP97348 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhodP97348 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhodP97348 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhodP97348 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhodP97348 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhodP97348 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RhodP97348 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhodP97348 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RhodP97348 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RhodP97348 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RhodP97348 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RhodP97348 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RhodP97348 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhodP97348 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhodP97348 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhodP97348 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhodP97348 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhodP97348 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RhodP97348 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhodP97348 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhodP97348 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhodP97348 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RhodP97348 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RhodP97348 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhodP97348 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhodP97348 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhodP97348 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhodP97348 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhodP97348 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhodP97348 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhodP97348 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhodP97348 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhodP97348 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RhodP97348 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhodP97348 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhodP97348 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhodP97348 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhodP97348 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RhodP97348 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhodP97348 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhodP97348 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RhodP97348 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RhodP97348 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhodP97348 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhodP97348 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhodP97348 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhodP97348 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhodP97348 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhodP97348 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhodP97348 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhodP97348 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhodP97348 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhodP97348 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhodP97348 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhodP97348 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhodP97348 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhodP97348 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhodP97348 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhodP97348 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhodP97348 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhodP97348 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhodP97348 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhodP97348 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhodP97348 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhodP97348 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhodP97348 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhodP97348 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhodP97348 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhodP97348 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhodP97348 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhodP97348 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhodP97348 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhodP97348 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhodP97348 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhodP97348 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhodP97348 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhodP97348 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhodP97348 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RhodP97348 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhodP97348 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhodP97348 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhodP97348 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhodP97348 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhodP97348 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhodP97348 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhodP97348 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhodP97348 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhodP97348 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RhodP97348 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhodP97348 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhodP97348 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhodP97348 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhodP97348 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhodP97348 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms