Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms