Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms