Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TgfbiP82198 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TgfbiP82198 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TgfbiP82198 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TgfbiP82198 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TgfbiP82198 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TgfbiP82198 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TgfbiP82198 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TgfbiP82198 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TgfbiP82198 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TgfbiP82198 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TgfbiP82198 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TgfbiP82198 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TgfbiP82198 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TgfbiP82198 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TgfbiP82198 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TgfbiP82198 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TgfbiP82198 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TgfbiP82198 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TgfbiP82198 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TgfbiP82198 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TgfbiP82198 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TgfbiP82198 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TgfbiP82198 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TgfbiP82198 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TgfbiP82198 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TgfbiP82198 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TgfbiP82198 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TgfbiP82198 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TgfbiP82198 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TgfbiP82198 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TgfbiP82198 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TgfbiP82198 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TgfbiP82198 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TgfbiP82198 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TgfbiP82198 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TgfbiP82198 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TgfbiP82198 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TgfbiP82198 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TgfbiP82198 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TgfbiP82198 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TgfbiP82198 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TgfbiP82198 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TgfbiP82198 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms