Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx1P81068 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx1P81068 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx1P81068 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx1P81068 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx1P81068 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx1P81068 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms