Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx2P81066 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx2P81066 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx2P81066 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Irx2P81066 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx2P81066 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx2P81066 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms