Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf6P70196 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf6P70196 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf6P70196 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf6P70196 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf6P70196 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf6P70196 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf6P70196 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf6P70196 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf6P70196 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms