Protein–RNA interactions for Protein: P62751

Rpl23a, 60S ribosomal protein L23a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23aP62751 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl23aP62751 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl23aP62751 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl23aP62751 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl23aP62751 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl23aP62751 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl23aP62751 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl23aP62751 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl23aP62751 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl23aP62751 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl23aP62751 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl23aP62751 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl23aP62751 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl23aP62751 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl23aP62751 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl23aP62751 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms