Protein–RNA interactions for Protein: P62080

Tspan5, Tetraspanin-5, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan5P62080 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms