Protein–RNA interactions for Protein: P61967

Ap1s1, AP-1 complex subunit sigma-1A, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s1P61967 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ap1s1P61967 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms