Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vbp1P61759 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vbp1P61759 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vbp1P61759 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vbp1P61759 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vbp1P61759 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vbp1P61759 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vbp1P61759 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vbp1P61759 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vbp1P61759 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vbp1P61759 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vbp1P61759 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vbp1P61759 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vbp1P61759 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vbp1P61759 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vbp1P61759 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vbp1P61759 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vbp1P61759 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vbp1P61759 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vbp1P61759 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vbp1P61759 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vbp1P61759 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vbp1P61759 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vbp1P61759 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vbp1P61759 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vbp1P61759 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vbp1P61759 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vbp1P61759 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vbp1P61759 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vbp1P61759 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vbp1P61759 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vbp1P61759 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vbp1P61759 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vbp1P61759 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vbp1P61759 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vbp1P61759 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vbp1P61759 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms