Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf13P61216 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf13P61216 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf13P61216 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf13P61216 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf13P61216 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf13P61216 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf13P61216 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf13P61216 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf13P61216 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf13P61216 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf13P61216 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf13P61216 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf13P61216 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf13P61216 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf13P61216 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf13P61216 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf13P61216 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf13P61216 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf13P61216 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf13P61216 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf13P61216 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf13P61216 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf13P61216 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf13P61216 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf13P61216 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf13P61216 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf13P61216 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf13P61216 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf13P61216 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf13P61216 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf13P61216 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf13P61216 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf13P61216 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf13P61216 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf13P61216 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf13P61216 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf13P61216 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf13P61216 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf13P61216 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf13P61216 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf13P61216 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf13P61216 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf13P61216 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms