Protein–RNA interactions for Protein: P61211

Arl1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl1P61211 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arl1P61211 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arl1P61211 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arl1P61211 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arl1P61211 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arl1P61211 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arl1P61211 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arl1P61211 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arl1P61211 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arl1P61211 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arl1P61211 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arl1P61211 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arl1P61211 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arl1P61211 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arl1P61211 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arl1P61211 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arl1P61211 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arl1P61211 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arl1P61211 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arl1P61211 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arl1P61211 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arl1P61211 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arl1P61211 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Arl1P61211 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arl1P61211 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arl1P61211 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arl1P61211 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arl1P61211 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arl1P61211 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arl1P61211 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Arl1P61211 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arl1P61211 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arl1P61211 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arl1P61211 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arl1P61211 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arl1P61211 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arl1P61211 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arl1P61211 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arl1P61211 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arl1P61211 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arl1P61211 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Arl1P61211 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arl1P61211 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arl1P61211 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms