Protein–RNA interactions for Protein: P61148

Fgf1, Fibroblast growth factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf1P61148 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fgf1P61148 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fgf1P61148 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fgf1P61148 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Fgf1P61148 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fgf1P61148 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fgf1P61148 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Fgf1P61148 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fgf1P61148 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fgf1P61148 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fgf1P61148 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fgf1P61148 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fgf1P61148 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fgf1P61148 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fgf1P61148 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fgf1P61148 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fgf1P61148 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fgf1P61148 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fgf1P61148 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fgf1P61148 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fgf1P61148 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fgf1P61148 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fgf1P61148 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fgf1P61148 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fgf1P61148 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fgf1P61148 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fgf1P61148 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fgf1P61148 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fgf1P61148 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fgf1P61148 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fgf1P61148 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fgf1P61148 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fgf1P61148 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fgf1P61148 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fgf1P61148 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fgf1P61148 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fgf1P61148 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Fgf1P61148 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Fgf1P61148 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fgf1P61148 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fgf1P61148 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fgf1P61148 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fgf1P61148 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fgf1P61148 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Fgf1P61148 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fgf1P61148 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms