Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ActbP60710 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ActbP60710 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
ActbP60710 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ActbP60710 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ActbP60710 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ActbP60710 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ActbP60710 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ActbP60710 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ActbP60710 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ActbP60710 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ActbP60710 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ActbP60710 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ActbP60710 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ActbP60710 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ActbP60710 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ActbP60710 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ActbP60710 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ActbP60710 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ActbP60710 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ActbP60710 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ActbP60710 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ActbP60710 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ActbP60710 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ActbP60710 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ActbP60710 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ActbP60710 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ActbP60710 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ActbP60710 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ActbP60710 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ActbP60710 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ActbP60710 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ActbP60710 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ActbP60710 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ActbP60710 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ActbP60710 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ActbP60710 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ActbP60710 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ActbP60710 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ActbP60710 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ActbP60710 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ActbP60710 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ActbP60710 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ActbP60710 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ActbP60710 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ActbP60710 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ActbP60710 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ActbP60710 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ActbP60710 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ActbP60710 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ActbP60710 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ActbP60710 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ActbP60710 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ActbP60710 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ActbP60710 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ActbP60710 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ActbP60710 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ActbP60710 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ActbP60710 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ActbP60710 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ActbP60710 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ActbP60710 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ActbP60710 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ActbP60710 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ActbP60710 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ActbP60710 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ActbP60710 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ActbP60710 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ActbP60710 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ActbP60710 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ActbP60710 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ActbP60710 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ActbP60710 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ActbP60710 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ActbP60710 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ActbP60710 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ActbP60710 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ActbP60710 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ActbP60710 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ActbP60710 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ActbP60710 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ActbP60710 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ActbP60710 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ActbP60710 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ActbP60710 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ActbP60710 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ActbP60710 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ActbP60710 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ActbP60710 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ActbP60710 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ActbP60710 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ActbP60710 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ActbP60710 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ActbP60710 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ActbP60710 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ActbP60710 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ActbP60710 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ActbP60710 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ActbP60710 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ActbP60710 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms