Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hps5P59438 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hps5P59438 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hps5P59438 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hps5P59438 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hps5P59438 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms