Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms