Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tpm2P58774 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms