Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms