Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bace1P56818 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Bace1P56818 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bace1P56818 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bace1P56818 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bace1P56818 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Bace1P56818 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bace1P56818 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bace1P56818 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bace1P56818 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bace1P56818 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms