Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdcd5P56812 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms