Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CckbrP56481 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CckbrP56481 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CckbrP56481 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CckbrP56481 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CckbrP56481 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms