Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Sh3bp1P55194 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Sh3bp1P55194 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Sh3bp1P55194 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Sh3bp1P55194 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Sh3bp1P55194 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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