Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pex2P55098 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pex2P55098 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pex2P55098 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pex2P55098 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pex2P55098 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pex2P55098 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pex2P55098 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pex2P55098 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pex2P55098 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pex2P55098 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pex2P55098 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pex2P55098 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pex2P55098 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pex2P55098 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pex2P55098 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pex2P55098 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pex2P55098 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pex2P55098 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pex2P55098 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pex2P55098 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pex2P55098 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pex2P55098 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pex2P55098 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pex2P55098 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pex2P55098 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pex2P55098 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pex2P55098 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pex2P55098 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pex2P55098 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pex2P55098 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pex2P55098 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pex2P55098 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pex2P55098 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pex2P55098 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pex2P55098 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pex2P55098 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pex2P55098 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms