Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms