Protein–RNA interactions for Protein: P53776

Lhx4, LIM/homeobox protein Lhx4, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx4P53776 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms