Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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