Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms