Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RorcP51450 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RorcP51450 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RorcP51450 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RorcP51450 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RorcP51450 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RorcP51450 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RorcP51450 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RorcP51450 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RorcP51450 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RorcP51450 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RorcP51450 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RorcP51450 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RorcP51450 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RorcP51450 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RorcP51450 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RorcP51450 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RorcP51450 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RorcP51450 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RorcP51450 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RorcP51450 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RorcP51450 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RorcP51450 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RorcP51450 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RorcP51450 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RorcP51450 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RorcP51450 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RorcP51450 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RorcP51450 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RorcP51450 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RorcP51450 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RorcP51450 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RorcP51450 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RorcP51450 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RorcP51450 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RorcP51450 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
RorcP51450 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RorcP51450 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RorcP51450 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RorcP51450 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RorcP51450 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RorcP51450 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RorcP51450 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RorcP51450 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RorcP51450 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RorcP51450 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RorcP51450 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RorcP51450 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RorcP51450 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RorcP51450 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RorcP51450 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RorcP51450 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RorcP51450 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RorcP51450 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RorcP51450 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RorcP51450 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RorcP51450 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RorcP51450 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RorcP51450 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RorcP51450 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RorcP51450 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RorcP51450 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RorcP51450 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RorcP51450 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RorcP51450 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RorcP51450 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RorcP51450 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RorcP51450 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RorcP51450 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RorcP51450 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RorcP51450 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RorcP51450 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RorcP51450 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RorcP51450 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RorcP51450 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RorcP51450 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RorcP51450 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RorcP51450 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RorcP51450 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RorcP51450 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RorcP51450 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RorcP51450 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RorcP51450 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RorcP51450 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RorcP51450 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RorcP51450 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RorcP51450 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RorcP51450 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RorcP51450 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RorcP51450 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RorcP51450 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RorcP51450 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RorcP51450 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RorcP51450 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RorcP51450 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RorcP51450 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RorcP51450 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RorcP51450 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RorcP51450 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RorcP51450 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms