Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TspoP50637 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TspoP50637 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TspoP50637 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TspoP50637 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TspoP50637 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TspoP50637 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TspoP50637 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TspoP50637 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TspoP50637 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TspoP50637 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TspoP50637 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TspoP50637 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TspoP50637 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TspoP50637 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TspoP50637 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TspoP50637 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TspoP50637 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TspoP50637 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TspoP50637 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TspoP50637 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TspoP50637 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TspoP50637 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TspoP50637 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TspoP50637 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TspoP50637 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TspoP50637 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TspoP50637 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TspoP50637 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TspoP50637 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TspoP50637 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TspoP50637 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TspoP50637 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TspoP50637 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TspoP50637 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TspoP50637 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TspoP50637 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TspoP50637 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TspoP50637 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TspoP50637 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TspoP50637 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TspoP50637 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TspoP50637 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TspoP50637 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TspoP50637 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TspoP50637 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TspoP50637 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TspoP50637 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TspoP50637 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TspoP50637 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TspoP50637 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TspoP50637 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TspoP50637 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TspoP50637 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TspoP50637 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TspoP50637 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TspoP50637 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TspoP50637 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TspoP50637 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TspoP50637 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TspoP50637 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TspoP50637 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TspoP50637 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TspoP50637 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TspoP50637 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TspoP50637 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TspoP50637 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TspoP50637 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TspoP50637 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TspoP50637 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TspoP50637 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TspoP50637 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TspoP50637 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TspoP50637 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TspoP50637 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TspoP50637 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TspoP50637 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TspoP50637 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TspoP50637 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TspoP50637 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TspoP50637 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TspoP50637 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TspoP50637 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TspoP50637 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TspoP50637 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TspoP50637 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TspoP50637 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TspoP50637 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TspoP50637 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TspoP50637 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TspoP50637 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TspoP50637 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TspoP50637 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TspoP50637 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TspoP50637 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TspoP50637 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TspoP50637 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TspoP50637 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TspoP50637 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TspoP50637 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms