Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FmodP50608 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FmodP50608 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FmodP50608 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FmodP50608 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FmodP50608 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FmodP50608 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FmodP50608 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FmodP50608 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FmodP50608 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FmodP50608 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FmodP50608 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FmodP50608 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FmodP50608 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FmodP50608 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FmodP50608 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FmodP50608 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FmodP50608 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FmodP50608 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FmodP50608 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FmodP50608 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FmodP50608 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FmodP50608 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FmodP50608 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FmodP50608 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FmodP50608 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FmodP50608 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FmodP50608 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FmodP50608 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FmodP50608 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FmodP50608 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FmodP50608 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FmodP50608 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FmodP50608 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FmodP50608 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FmodP50608 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FmodP50608 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FmodP50608 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FmodP50608 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FmodP50608 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FmodP50608 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FmodP50608 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FmodP50608 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FmodP50608 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FmodP50608 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FmodP50608 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FmodP50608 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FmodP50608 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FmodP50608 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FmodP50608 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FmodP50608 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FmodP50608 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FmodP50608 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FmodP50608 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FmodP50608 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FmodP50608 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FmodP50608 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FmodP50608 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FmodP50608 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FmodP50608 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FmodP50608 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FmodP50608 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FmodP50608 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FmodP50608 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FmodP50608 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FmodP50608 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FmodP50608 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FmodP50608 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FmodP50608 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FmodP50608 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FmodP50608 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FmodP50608 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FmodP50608 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FmodP50608 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FmodP50608 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FmodP50608 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FmodP50608 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FmodP50608 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FmodP50608 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FmodP50608 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FmodP50608 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FmodP50608 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FmodP50608 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FmodP50608 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FmodP50608 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FmodP50608 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FmodP50608 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FmodP50608 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FmodP50608 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FmodP50608 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FmodP50608 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FmodP50608 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FmodP50608 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FmodP50608 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FmodP50608 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FmodP50608 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FmodP50608 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FmodP50608 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FmodP50608 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FmodP50608 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms