Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LtbrP50284 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LtbrP50284 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LtbrP50284 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LtbrP50284 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LtbrP50284 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LtbrP50284 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LtbrP50284 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LtbrP50284 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LtbrP50284 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LtbrP50284 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LtbrP50284 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LtbrP50284 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LtbrP50284 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LtbrP50284 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LtbrP50284 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
LtbrP50284 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LtbrP50284 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LtbrP50284 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LtbrP50284 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LtbrP50284 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LtbrP50284 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LtbrP50284 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LtbrP50284 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LtbrP50284 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LtbrP50284 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LtbrP50284 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LtbrP50284 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LtbrP50284 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LtbrP50284 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LtbrP50284 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LtbrP50284 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LtbrP50284 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LtbrP50284 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LtbrP50284 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LtbrP50284 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LtbrP50284 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LtbrP50284 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LtbrP50284 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LtbrP50284 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LtbrP50284 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LtbrP50284 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LtbrP50284 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LtbrP50284 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LtbrP50284 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LtbrP50284 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LtbrP50284 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LtbrP50284 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LtbrP50284 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LtbrP50284 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LtbrP50284 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LtbrP50284 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LtbrP50284 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LtbrP50284 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
LtbrP50284 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LtbrP50284 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LtbrP50284 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LtbrP50284 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LtbrP50284 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LtbrP50284 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LtbrP50284 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LtbrP50284 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LtbrP50284 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LtbrP50284 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LtbrP50284 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LtbrP50284 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LtbrP50284 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LtbrP50284 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LtbrP50284 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LtbrP50284 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
LtbrP50284 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LtbrP50284 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LtbrP50284 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LtbrP50284 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LtbrP50284 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LtbrP50284 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LtbrP50284 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LtbrP50284 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LtbrP50284 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LtbrP50284 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LtbrP50284 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LtbrP50284 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LtbrP50284 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LtbrP50284 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LtbrP50284 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LtbrP50284 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LtbrP50284 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LtbrP50284 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LtbrP50284 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LtbrP50284 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LtbrP50284 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LtbrP50284 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LtbrP50284 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LtbrP50284 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LtbrP50284 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LtbrP50284 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LtbrP50284 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LtbrP50284 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LtbrP50284 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LtbrP50284 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms