Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epb42P49222 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epb42P49222 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Epb42P49222 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epb42P49222 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epb42P49222 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Epb42P49222 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epb42P49222 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Epb42P49222 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms