Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ercc3P49135 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms